Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc78D3Z5T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc78D3Z5T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc78D3Z5T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms