Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc6D3YZP9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc6D3YZP9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc6D3YZP9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc6D3YZP9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms