Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samd1D3YXK1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samd1D3YXK1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms