Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo5D3YW29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo5D3YW29 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo5D3YW29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms