Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe3B9EKK6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe3B9EKK6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nxpe3B9EKK6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nxpe3B9EKK6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms