Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20547B8JJN0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20547B8JJN0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20547B8JJN0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms