Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce3B5KM66 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syce3B5KM66 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms