Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr3aB2RXC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr3aB2RXC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Polr3aB2RXC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Polr3aB2RXC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.3 ms