Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700018F24RikB2RW27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700018F24RikB2RW27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms