Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd34aB2RW11 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34aB2RW11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd34aB2RW11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms