Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5483B2RV77 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5483B2RV77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5483B2RV77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5483B2RV77 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5483B2RV77 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5483B2RV77 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5483B2RV77 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5483B2RV77 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5483B2RV77 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5483B2RV77 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms