Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brpf1B2RRD7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brpf1B2RRD7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms