Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm438B1ASB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms