Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik3B1AS29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik3B1AS29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik3B1AS29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms