Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skint2A7XUX6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms