Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Skint3A7TZF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint3A7TZF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms