Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930435E12RikA6X8Z9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms