Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll2A4Q9E4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttll2A4Q9E4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms