Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Odf2A3KGV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Odf2A3KGV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms