Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r232A2RTT5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r232A2RTT5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms