Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms