Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samt1A2BED8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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