Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef25A2ASI9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef25A2ASI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef25A2ASI9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef25A2ASI9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef25A2ASI9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms