Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgr4A2ARI4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lgr4A2ARI4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr4A2ARI4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr4A2ARI4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr4A2ARI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr4A2ARI4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr4A2ARI4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms