Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtf1A2AQ19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtf1A2AQ19 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
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