Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam209A2APA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam209A2APA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam209A2APA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms