Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd4A2AFR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd4A2AFR3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd4A2AFR3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms