Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbf1A2A870 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbf1A2A870 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbf1A2A870 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms