Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6268A2A3U9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm6268A2A3U9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm6268A2A3U9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms