Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam71e1A1L3C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam71e1A1L3C1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms