Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc112A0AUP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc112A0AUP1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms