Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930469K13RikA0A286YDB2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930469K13RikA0A286YDB2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930469K13RikA0A286YDB2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930469K13RikA0A286YDB2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms