Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms