Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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