Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms