Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv4A0A075B5I2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trbv4A0A075B5I2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Trbv4A0A075B5I2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv4A0A075B5I2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv4A0A075B5I2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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