Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ubl3Q9Z2M6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ubl3Q9Z2M6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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