Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trip6Q9Z1Y4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms