Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atp11cQ9QZW0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atp11cQ9QZW0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atp11cQ9QZW0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms