Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rdh11Q9QYF1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms