Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChmQ9QXG2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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