Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col5a3Q9JLI2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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