Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms