Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Slc28a3Q9ERH8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms