Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf6Q9DBU5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf6Q9DBU5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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