Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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