Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Chmp5Q9D7S9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Chmp5Q9D7S9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Chmp5Q9D7S9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp5Q9D7S9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp5Q9D7S9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms