Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem54Q9D7S1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem54Q9D7S1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem54Q9D7S1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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