Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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