Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9bQ9D6E4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms